PCR实验室又称为基因扩增实验室，因其特殊功能，建设时的配置要求要远远高于普通实验室，应通过各种措施，保证环境温度、湿度控制在一定范围之内。根据实验流程，房间功能分别为样品准备区，标本制备区，基因增扩区，物产分析区几个区域，规范对此区域没有洁净度的要求，如果此区域采用空调净化，可以采用十万级净化洁净度。

PCR实验室通常采用非单向流送风方式，上送下回式。上部送风依靠高效送风口进入房间，下部回风依靠每个房间的对称分布的排风柱下部的排风口排风。新风从室外进入处理机组，经过粗效、中效、亚高效、表冷(热)段、喷淋段(加湿)几个处理过程，然后进入洁净室。

排风分为全面换气与局部排风两部分，全面排风口一般位于排风柱的下部，设可调带过滤网的百叶风口，送风口采用高效过滤送风口。局部排风为房间设置Ⅱ级B2型生物安全柜的局部排风，柜面风速要求不小于5m/s，生物安全柜独立设置排风系统，排风口要求设置在建筑物的屋面上，生物安全柜排风管与所在室内的全面排风互锁，局部排风与全面排风不能同时开启。新风机组与排风系统都采用变频系统，以应对不同变风量处理过程。

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